银行保函与信用证都是银行开立的，同属于银行信用，而且都被用于国际贸易中的货款支付，但两者有很大的区别，主要表现在：
1、银行付款责任不同
在信用证业务中，开证行承担性付款责任;在银行保函业务中，见索即付保函银行承担性付款责任，而有条件保函银行则承担第二性付款责任。
2、适用范围不同
信用证业务一般只适用于货物买卖，而银行保函除适用货物买卖外，更多的用于国际工程承包、投标招标、借款贷款等业务，因而适用范围更广。
3、对单据要求不同
信用证项下货运单据是付款的依据，单证不符银行可拒付，银行保函项下单据不是付款的依据，一般凭索赔书或其他文件付款。
4、能否融资不同
信用证项下受益人可通过议付取得资金融通，而银行保函项下单据不成为索汇的依据，也不能作抵押贷款，受益人不能取得资金融通。
5、与合同关系不同
信用证与合同是两个完全独立的契约;而出具有条件的保函的银行，当受益人以对方不履约，提交书面陈述或证明，要求银行履行赔偿诺言时，银行一般须证实不履约的情况，如果双方意见不一，保证银行就会被牵连到交易双方的合同纠纷中去。有的国家，如美国、日本等，法律禁止银行介入商事纠纷，故不允许银行开立银行保函。
银行保函是指银行应委托人的申请而开立的有担保性质的书面承诺文件，一旦委托人未按其与受益人签订的合同的约定偿还债务或履行约定义务时，由银行履行担保责任。它有以下两个特点：
1、保函依据商务合同开出，但又不依附于商务合同，具有独立法律效力。当受益人在保函项下合理索赔时，担保行就必须承担付款责任，而不论委托人是否同意付款，也不管合同履行的实际事实。即保函是独立的承诺并且基本上是单证化的交易业务。
2、银行信用作为保证，易于为合同双方接受。
综上所述，保函和信用证广泛应用于国际贸易中，银行保函和信用证的区别主要体现在两者对银行付款责任、适用范围、与合同关系等方面都是不同的。信用证比保函应用的更灵活些，持有方可以用来融资，并且从范围上看，信用证可以使用的领域更广，几乎涵盖整个国际贸易。
银行保函又称"银行保证书"、"银行信用保证书"，简称"保证书"，银行作为保证人向受益人开立的保证文件。银行保函包括履约保函、不上网保函、上网保函、预付款保函、投标保函、维修保函、预留金保函、税款保付反担保函、海关风险保证金保函等。
履约保函的优点对承包方或供货方：减少由于缴纳现金保证金引起的长时间资金占压，获得资金收益；与缴纳现金保证金相比，可以使有限的资金得到优化配置；权益得到更好地维护。对业主或买方：合理制约承包人、供货方行为，良好维护自身利益；避免收取、退回保证金程序的繁琐，提高工作效率。