根据相关法律规定，农民工工资保证金确实可以使用金融机构出具的保函来替代。《保障农民工工资支付条例》第三十二条明确指出，“工资保证金可以用金融机构保函替代”，这意味着除了传统的现金缴存方式外，还可以通过保函的方式来满足这一制度的要求。
关税保函（Guarantee for the Customs Duties）是指担保银行应进口商（含加工贸易企业）的申请而向海关出具的、保证进口商履行缴纳关税义务的书面文件。关税保函主要包括两种类型，即关税保付保函、加工贸易税款保付保函。
租赁保函是保证人应承租人的要求，向出租人开立的保证，承租人按照合同的规定支付租金，否则将由保证人进行赔付的书面保证文件。租赁保函的金额应与租金及相应的利息相等，一般自承租人收到租赁设备并验收合格后生效，至承担人支付完全部的租金或双方的时期失效。
租赁保函作用
1、对出租方
·便利了租赁合约的执行；
·获得了及时收回租金的保障。
2、对承租方
·有利于承租方取得设备使用权；
·获得资金融通、促进资金周转。