观察法。
它是指审计人员亲临建筑现场，对审计事项进行实地观察，调查了解建设项目的实际情况，发现疑点，验证事实，核实实际工程量，审定工程造价的一种方法。
询问法。
它是指审计人员通过询问被审计单位参与基建项目管理的负责人、当事人、知情人或施工单位施工员、预算员、知情者，以证实基建工程量与工程价款的真实性、合理性的一种方法。审计人员通过询问获得的审计线索有可能引出有力的审计证据，揭露事实的真相。所以询问法也是基建工程决算审计直接、常用的一种有效的方法。
调查法。
它是指审计人员深入实际进行调查研究，以查证基建工程量与工程价款的真实性、合理性的一种方法。如对水电主材价格进行市场调查分析，对基建工程量进行调查走访等。调查法是基建工程决算审计一种切实可行的有效方法。如审计人员某年对某单位一建筑基建工程决算进行审计，运用调查法核减隐蔽工程造价与水电主材造价合计18万余元。
重点抽查审计法。确定工程量大或造价较高、工程结构复杂的工程为重点，确定监理工程师签证的变更工程为重点，确定基础隐蔽工程为重点，确定采用新工艺、新材料工程为重点，确定甲乙双方自行协商增加工程项目为重点。抓住工程造价中的重点进行审计。